Capstone Project memberikan kesempatan kepada mahasiswa secara langsung untuk mensintesis, mengintegrasi dan mengaplikasikan keahlian dan kompetensi yang didapat selama perkuliahan untuk menyelesaikan permasalahan yang ada di lapangan. Proyek dilakukan untuk melatih mahasiswa berpikir kritis dan dapat memberikan solusi terhadap masalah sistem informasi kesehatan yang ada. Capstone project bukanlah thesis sehingga tidak bertujuan mendapatkan kebaruan dan temuan penelitian, namun memberikan bukti nyata atau demonstrasi keahlian/kemampuan yang relevan dengan praktik profesional. Mahasiswa dapat memilih topik yang diinginkan dalam pengerjaan proyek ini. Bentuk proyek dapat berupa literature review, pelaksanaan program, evaluasi program, analisis kebijakan, proposal penelitian, pelaporan hasil riset. Pada tahap akhir, mahasiswa akan mempresentasikan hasil capstone project yang sudah dilaksanakan.
Beberapa contoh Capstone Project yang dilakukan oleh mahasiswa SIMKES yaitu
- Pengembangan Sistem Penanggulangan Gawat Darurat Terpadu (SPGDT)
- Pengembangan Portable Health Care
- Pengambangan Electronic Medial Record Rumah Sakit dan Puskesmas